Software de avaliação genética de bovinos tem nova versão

Uma nova versão do Intergen , software de avaliação genética de bovinos, já está à disposição do setor de pecuária de corte no Brasil. Lançada em 2008 e expandida em 2016 pela Embrapa, uma ferramenta foi atualizada, com a introdução de módulos para processamento de dados genômicos e inclusão de um número ilimitado de animais na avaliação genética. Com isso, o sistema operacional, que antes atendeu principalmente o PampaPlus , da Associação Brasileira de Hereford e Braford ( ABHB ), passa a assistir também outras duas iniciativas voltadas ao melhoramento genético de raças bovinas europeias no País: o Programa de Melhoramento de Bovinos de Bovinos de Carne (Promebo), da Associação Nacional de Criadores Herd-Book Collares ( ANC ) e o Brangus + , da Associação Brasileira de Brangus . 

Os novos módulos – IntergenIOD e IntergenACC – apresentam três novas funcionalidades, fundamentais para os programas de melhoramento genético na atualidade: a possibilidade de inserção de informação genômica, a capacidade de estimar o mérito genético para um número ilimitado de animais e a estimativa aproximada da acurácia desse mérito genético. 

Vinícius Junqueira, pesquisador que realizou seus estudos de mestrado e doutorado no Laboratório de Bioinformática e Estatística Genômica (Labegen) da Embrapa Pecuária Sul (RS), conta que os programas de avaliação genética já utilizam informações genômicas para estimar os méritos dos animais, o que proporcionou avanços na taxa de ganho genético das populações avaliadas, mas também desafios computacionais no processamento dessas informações. “Os módulos IntergenIOD e IntergenACC foram específicos para superar esses desafios computacionais. O IntergenIOD foca na pesquisa do mérito genético dos animais com uso mínimo de memória RAM, enquanto o IntergenACC fornece uma estimativa aproximada da acurácia do mérito genético estimado pelo IntergenIOD”, explica Junqueira. 

Segundo Henry Carvalho , analista do Labegen, a atualização o trabalho de avaliação genética, a partir da possibilidade de processamento de diversas análises de dados ao mesmo tempo. “O IntergenIOD ocupa muito menos memória. O mesmo ocorre com o IntergenACC, que também ocupa pouca memória e chega aos resultados de acurácia aproximados em poucos minutos, podendo inclusive rodar em paralelo com o IntergenIOD, pois não depende dos resultados do IntergenIOD para calcular as acurácias aproximadas”, relata.

O objetivo é trazer mais precisão, rapidez e eficiência ao processo de resolução das equações de valor genético dos animais e melhorar a acurácia dos valores genéticos calculados, que é a diferença esperada na progênie (DEP). Essas informações processadas são cruciais para o avanço do aprimoramento de recursos de interesse através das gerações. 

“Estamos migrando todos os nossos sistemas de avaliação para essa nova versão do Intergen, de forma a fornecer informações cada vez mais apuradas, usando todos os dados que temos disponíveis, auxiliando o produtor na tomada de decisão. Apesar da mudança no processo, estamos realizando essa transição com muita confiança de que os programas de melhoramento genético continuarão rodando com a mesma qualidade de sempre”, destacou o chefe-geral da Embrapa Pecuária Sul, Fernando Cardoso .  

Fonte: Embrapa Foto: Felipe Rosa